Metagenoma I Shotgun

Que precisamos investigar, compreender e cuidar do nossa micro.BIOMA já estamos cansados de saber!

O microbioma é o conjunto de genomas dos microrganismos presentes em nosso corpo. São microrganismos essenciais para o desempenho de funções vitais, como digestão de alimentos, metabolização de medicamentos, modulação do sistema imunológico, produção de hormônios etc etc etc.

Falo isso desde a minha época de estágio no Hospital Federal de Ipanema com o Dr. Fernando Luiz Barroso. A novidade é que na ultima década houve uma certa revolução no sequenciamento genético como um todo; e especificamente para a análise do microbioma, com o Sequenciamento de Nova Geração {Next Generation Sequencing, NGS} Enquanto o ´sanger {método anterior de análise} sequenciava os fragmentos de DNA individualmente, o NGS I Shotgun é uma técnica de sequenciamento em larga escala, no qual milhões e até bilhões de fragmentos são sequenciados simultaneamente em uma única corrida.

Iniciei minha carreira muito cedo.. mesmo antes de me formar na primeira graduação, eu já trabalhava na área, supervisionada por uma equipe de profissionais admiráveis {trago cada um deles em meu coração até hoje e serei eternamente grata por tantos ensinamentos; tantas ricas vivências}

A experiência me foi bem ampla em clínica médica, mas tínhamos foco na gastroenterologia {clínica e cirúrgica} e a partir disso meu encantamento pelo microbioma humano cresceu exponencialmente.

Minha primeira especialização foi então em genômica e metagenômica e desde a conclusão desta pós formação, solicito o perfil genético de meus pacientes para um trabalho muito meu ☺️ no qual associo a medicina integrativa com a prática ortomolecular para cuidar da epigenética de cada um que me pede auxílio. Sou suspeita, mas é algo lindo.. e o mais importante; eficiente!

Bem, vim aqui hoje só para contar que a nova análise do microbioma através da tecnologia de sequenciamento por shotgun, seguido de análise por bioinformática, me permite conhecer todos os microrganismos presentes na amostra analisada e identificá-los com precisão em nível de cepas. Consigo compreender a taxa de diversidade {a diversidade da microbiota é considerada um dos principais aspectos relacionados a um microbioma saudável; uma alta taxa de variabilidade é super positiva em relação aos aspectos gerais de saúde} além da proporção de firmicutes e bacteroidetes {o que determina; em parte, a facilidade ou dificuldade de adequação dos compartimentos corporais de gordura e massa magra} os tipos de fungos, dentre outros tantos detalhes que influenciam a expressão gênica de cada paciente.

Pelo ´trigger consigo delinear as melhores estratégias da medicina do estilo de vida, almejando a adequação da microflora intestinal e urogenital; na verdade na verdade, do metagenoma como um todo e assim trabalhar na prevenção de inúmeras doenças crônicas {algumas agudas também} e no resgate da vitalidade positiva.. da SAÚDE PLENA.

 

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